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第314章 耳听为虚,眼见为实(1 / 2)

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因为刘仁华忽然想到一个事情。

耳听为虚,眼见为实。

这年头,人造天才可以说比人造肉还便宜。

论文靠导师挂名,成果靠团队喂养,数据靠精修,故事靠包装。

发了两篇顶刊,然后通稿立刻满天飞。

百年一遇、横空出世、颠覆领域......

媒体一吹,同行一捧,帽子一戴。

然后天才就成了。

可凑近一看的时候,实验是师兄跑的,代码是师弟写的,图是师妹画的。

天才本人最擅长的,是在组会上说这个方向很有前景。

一旦离开平台、断了资源、撤了团队,立刻原形毕露。

人造的天才,是流量吹起来的。

只有真正的天才,是时间筛出来的。

吹得越高,摔得越响。

毕竟,气球再大,也经不起一根针。

这个林晓究竟是不是被吹起来的天才。

只要近距离接触过一段时间就知道了。

刘仁华顿时计上心头。

现在不就是一个机会吗?

看到那人没说话,只是走到工位旁边,拉了一把椅子坐下来。

林晓把屏幕转向他这边,指着一列文件:“这批玉米自交系的基因型数据,格式是VCF,里面有大概两百多万个SNP位点。”

“你先帮我把这些文件按染色体拆分,每条染色体单独存一个文件,然后用PLINK做一遍基础质控。”

“MAF过滤到0.05,缺失率过滤到0.1,剩下的位点再跑一次哈迪-温伯格平衡检验,值小于1e-6的标记出来。”

“这个你应该会吧?”

刘仁华听完心里有些小意外。

这个研究生确实有点水平啊。

知道要用PLINK做基础质控,确实没什么。

毕竟只是几条命令的事,MAF、缺失率、HWE,参数一填,结果就出来了。

这套流程任何一个上过生信课的研究生都能跑。

但知道哈迪-温伯格平衡检验就不一样了。

它看着只是一行公式。

但真要做到每条染色体、每个位点、每批样本都算一遍,还要处理缺失基因型、多等位位点、群体分层带来的假阳性。

这个计算量和边界条件直接爆炸。

更麻烦的是,大规模数据下不能简单循环,必须做矩阵化、分块并行,还得保证值精度不丢。

简而言之,后者是见真功夫的事情。

看到那人点了点头,林晓随即翻到另一个窗口,调出了一组已经处理好的表型数据。

“这组是西南育种站的表型记录,包含株高、穗位高、倒伏率、籽粒产量四个性状。”

“你做完之后,再帮我把基因型和表型按品种编号做一次匹配。”

“确认没有对应不上的个体。”

毕竟不是他亲自动手,还是要看一眼才放心。

林晓还是跟在旁边看了几眼。

只见到他说完之后,那人已经打开了终端窗口,手指在键盘上快速输入了一行命令。

林晓看了一眼他敲的指令,发现参数格式完全正确。

而且他顺带加了一个日志输出路径,可以把每一步的运行状态单独存下来,方便后续排查。

看到这里,林晓就没有再看了。