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第333章 下一篇,剑指Science!(1 / 2)

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当然,放在林晓身上,他却觉得乐在其中。

主要这不是重复劳动。

没有调试别人留下的代码,也没有为了发一篇论文而做一件明知结果的事情。

他在创造一个之前不存在的东西。

这种从零到一的创造过程,让他有一种持续的、稳定的兴奋感。

于是,林晓来到鹏城的第六天。

晚上十点二十一分。

他按下最后一次运行键,屏幕上弹出了算法完成的提示窗口。

所有模块的状态都显示为绿色。

最后一轮贝叶斯优化返回了最优参数组合,质量评估网络在验证集上的准确率超过了阈值。

构象分类器输出的聚类簇数量和分布范围都符合预期。

他把日志文件从头到尾翻了一遍,确认没有遗漏的错误信息,然后把最终的输出结果保存到指定的目录中。

林晓长吐一口气。

终于是特么搞完了。

之前的所有努力都不算辜负。

虽然最开始只是源自一个灵感。

但为了实现它,林晓也算是把自己榨干了。

这个算法基本上调用了林晓之前掌握的所有知识体系。

统计耦合分析的数学框架、空间转录组跨批次偏移的识别逻辑、贝叶斯优化的参数搜索、卷积神经网络的质量评估、以及冷冻电镜密度图的处理经验。

每一块都是他过去几年里在不同方向上积累下来的,这个算法把它们全部串在了一起,可以说是他这个时期内的巅峰之作。

此时此刻。

林晓的心情无比激动。

有一种说不出来的成就感。

这种感觉甚至更甚于,他之前在华盛顿国际计算生物学学会领取奥弗顿奖的时候。

但原因其实很简单。

并不仅仅只是帮鹏湾实验室解决了建模的难题。

更重要的原因是,林晓对算法有了更深的理解。

也找到了自己未来很长一段时间里,可以一直为之努力去研究的方向。

这一点反而比单纯解决某个问题更让他激动。

他感觉自己正走在正确的路上。

研究算法这么久,他可能之前还是没有太意识到人工智能的重要性。

其实用计算机来研究生物学问题,在现在这个时代已经变得非常重要。

和之前的邓鸿奎一样的传统生物学家,可能并没有意识到。

或者是潜意识里清楚,但心里的傲慢让他们下意识忽略掉了这一点。

那就是曾是冷门学科的计算生物学,正在逐渐变成了引领式学科。

这一点能从2018年DeeMd的AlhaFold忽然横空出世就能看出来。

仅凭氨基酸序列就能预测蛋白质的3D结构,就一举攻克了困扰生物学界五十年的蛋白质折叠问题。

2020年,AlhaFold2的问世被《科学》杂志评为年度突破,其预测的2亿多个蛋白质结构几乎涵盖了所有已知蛋白质,为研究提供了前所未有的资源库。

施公曾评价其是能对科学领域最大的一次贡献和21世纪最重要的科学突破之一。

原本以为人工智能在蛋白质解析的方向上已经似乎被运用到了极致。

其预测的蛋白质结构都达到原子水平的准确度了。

DeeMd甚至都公布了大约2.2亿种蛋白质的预测结构。

几乎涵盖了DNA数据库中已知生物体的所有蛋白质。