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他随口开口闲聊:“你们这周看bioRxiv那篇植物根系单细胞图谱的预印本了吗?”
威廉姆斯挑眉应声:“是Meta团队那篇?”
“没错。”卢卡斯点点头,语气带着几分玩味,“他们新提的降维策略,号称比经典Seurat整合算法效果高出十四个百分点。”
威廉姆斯当即嗤笑一声,满是无奈:“我现在听到Meta分析就头疼。一次性整合二十个数据集提炼共性特征,最后跑出一个全新细胞亚群,谁能保证这是真实生物学性状,不是数据集批次误差拼凑出来的假象?”
“你说到最关键的地方了。”卢卡斯压低声音,凑近几分,“我看完通篇最大的感受就是,结果太完美了,完美得反常。三十份样本、三个完全不同的建库平台,居然没有一处平台特异性离群簇,太干净了。”
“说白了就是疑似人工修饰。”他抿了一口酒,继续说道,“就像孟德尔当年的豌豆实验,数据规整得过分完美,后世一直有人质疑,是不是刻意剔除了不符合规律的植株。我严重怀疑这篇预印本,是预处理阶段强行过滤掉了异常数据,才凑出的漂亮结果。”
安东尼适时轻咳一声,提醒道:“私下聊聊没关系,别说得太绝对、太重了。”
“我也就随口吐槽,又没写公开评论质疑。”卢卡斯摆了摆手,一脸无所谓。
"你私下说不要紧,但你得把逻辑理清楚。
"安东尼的语调不急不缓:
"孟德尔的数据被质疑了大半个世纪,但现代遗传学重新分析他的原始实验记录之后,结论是......”
“他的数据在统计学上确实可能存在轻微的偏差,但那些偏差不影响他的核心发现。”
“你类比这茬,意思是那篇ta的核心发现即使有数据清洗上的争议,也不影响它的生物学结论?
"
卢卡斯瞬间卡壳,愣了一下:
"……我这类比不是这个意思。
"
"那你类比什么?
"
"我类比的是......
"卢卡斯想了半天:
"数据太好看了,让人本能地想怀疑。
"
威廉姆斯跟着补了一刀:
"你刚才说的那个话,翻译过来就是,我觉得它在造假,但我没证据。这跟孟德尔当年的质疑者有什么区别?
"
"区别在于我又没写匿名评论。
"
"你嘴上不说,脑子上写了。
"
“我只是私下怀疑,又没公开发难!”
顿时,整个角落都弥散出笑声来。
喧闹间,林晓端着酒杯淡淡一笑,轻声开口:“我倒是想到了另一个角度。”
几人瞬间收敛笑意,齐齐转头看向他。
“你们刚才争论的Meta降维分析,和孟德尔当年的显隐性比例归纳,底层数学逻辑其实是一模一样的。”
桌面瞬间安静下来,所有人都来了兴致。
安东尼微微前倾身体,语气认真:“你展开说说。”
“孟德尔当时没有显微镜,没有测序仪,他所有的数据都是表型计数。”
“他做的事情其实是从大量个体中提取出一种模式。高茎和矮茎的分离比是3比1,圆粒和皱粒也是3比1。他根本不知道什么是基因,但他从数据里抽出了一套规律。
"
看着几人陷入沉思,林晓于是继续说道。